Informatie

Lab 8: Biochemische testen gebruiken om bacteriën te identificeren - Biologie

Lab 8: Biochemische testen gebruiken om bacteriën te identificeren - Biologie


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

In de drie voorgaande labs hebben we bacteriën microscopisch onderzocht. Afgezien daarvan geeft microscopische observatie echter weinig aanvullende informatie over het geslacht en de soort van een bepaalde bacterie.

Om bacteriën te identificeren, moeten we sterk vertrouwen op biochemische testen. De soorten biochemische reacties die elk organisme ondergaat, fungeren als een "duimafdruk" voor de identificatie ervan. Dit is gebaseerd op de volgende logica:

  • Elke verschillende bacteriesoort heeft: een ander molecuul DNA (d.w.z. DNA met een unieke reeks nucleotidebasen).
  • Omdat DNA codeert voor eiwitsynthese, moeten verschillende soorten bacteriën, door middel van hun unieke DNA, in staat zijn om te synthetiseren verschillende eiwit enzymen.
  • Enzymen katalyseren alle verschillende chemische reacties waartoe het organisme in staat is. Dit betekent op zijn beurt dat verschillende soorten bacteriën moeten uitvoeren verschillende en unieke sets van biochemische reacties.

Wanneer u een verdacht organisme identificeert, ent u een reeks differentiële media (zie Lab 3). Na incubatie observeer je vervolgens elk medium om te zien of specifieke eindproducten stofwisseling aanwezig zijn. Dit kan door toe te voegen indicatoren op het medium dat specifiek reageert met het geteste eindproduct, waardoor een vorm van zichtbare reactie zoals een kleurverandering. De resultaten van deze tests op het verdachte micro-organisme worden vervolgens vergeleken met bekende resultaten voor dat organisme om de identificatie ervan te bevestigen.

Lab 7 zal aantonen dat verschillende bacteriën, vanwege hun unieke enzymen, in staat zijn tot verschillende biochemische reacties. Het zal ook de resultaten van de activiteit van die enzymen laten zien. In latere laboratoria zullen we een breed scala aan differentiële media voor speciale doeleinden gebruiken die vaak in het klinische laboratorium worden gebruikt om specifieke pathogene en opportunistische bacteriën te identificeren.

Over het algemeen kunnen we enzymen classificeren als exo-enzymen of endo-enzymen. Exo-enzymen worden door bacteriën uitgescheiden in de omgeving om grotere voedingsmoleculen af ​​te breken zodat ze de bacterie kunnen binnendringen (zie figuur 1A). Eenmaal in het organisme worden sommige voedingsstoffen verder afgebroken om energie op te leveren voor het aansturen van verschillende cellulaire functies, terwijl andere worden gebruikt om bouwstenen te vormen voor de synthese van cellulaire componenten. Deze latere reacties worden gekatalyseerd door endo-enzymen zich in de bacterie bevinden.

A. ZETMEELHYDROLYSE

DISCUSSIE

Zetmeel is een polysacharide dat verschijnt als een vertakt polymeer van de enkelvoudige suikerglucose. Dit betekent dat zetmeel eigenlijk een reeks glucosemoleculen is die aan elkaar zijn gehaakt om een ​​lange keten te vormen. Extra glucosemoleculen vertakken zich vervolgens van deze keten, zoals hieronder weergegeven.

GLU
|
( ---GLU-GLU-GLU-GLU-GLU-GLU-GLU--- )n

Sommige bacteriën zijn in staat zetmeel als koolhydraatbron te gebruiken, maar om dit te doen, moeten ze eerst hydrolyseren of afbreken het zetmeel zodat het de cel kan binnendringen. De bacterie scheidt een exo-enzym af dat het zetmeel hydrolyseert door de bindingen tussen de glucosemoleculen te verbreken. Dit enzym heet a diastase.

( ---GLU / GLU / GLU / GLU / GLU / GLU / GLU--- )n
actie van diastase

De glucose kan dan de bacterie binnendringen en worden gebruikt voor de stofwisseling.

MEDIUM

Zetmeelagar (één bord)

ORGANISMEN

Trypticase Soja bouillon culturen van Bacillus subtilis en Escherichia coli.

PROCEDURE (te doen in tweetallen)

1. Teken met een wasmarker een lijn op de onderkant van een zetmeelagarplaat om de plaat in tweeën te delen. Label de ene helft B. subtilis en de andere helft E coli.

2. Maak een enkele streeplijn met het juiste organisme op de overeenkomstige helft van de plaat, zoals weergegeven in Fig. 6.

3. Incuberen ondersteboven en gestapeld in de petrischaalhouder op de plank van de 37°C-incubator die overeenkomt met uw laboratoriumsectie tot de volgende labperiode.

4. Volgende periode, jodium zal worden toegevoegd om te zien of het zetmeel in de agar blijft of is gehydrolyseerd door het exo-enzym diastase. Jodium reageert met zetmeel om een ​​donkerbruine of blauw/zwarte kleur te produceren. Als zetmeel is gehydrolyseerd, is er een duidelijke zone rond de bacteriegroei (zie Fig. 3A) omdat het zetmeel niet meer in de agar zit om met het jodium te reageren. Als het zetmeel niet is gehydrolyseerd, blijft de agar donkerbruin of blauw/zwart van kleur (zie afb. 3B).

B. EIWITHYDROLYSE

DISCUSSIE

Eiwitten zijn opgebouwd uit verschillende aminozuren die door middel van peptidebindingen in lange ketens aan elkaar zijn gekoppeld. Veel bacteriën kunnen een verscheidenheid aan eiwitten hydrolyseren tot peptiden (korte ketens van aminozuren) en uiteindelijk tot individuele aminozuren. Ze kunnen deze aminozuren vervolgens gebruiken om hun eigen eiwitten en andere cellulaire moleculen te synthetiseren of om energie te verkrijgen. De hydrolyse van eiwit wordt genoemd proteolyse en het betrokken enzym heet a protease. In deze oefening zullen we testen op bacteriële hydrolyse van het eiwit caseïne, het eiwit dat melk zijn . geeft wit, ondoorzichtig uiterlijk.

MEDIUM

Magere melk-agar (één bord)

ORGANISMEN

Trypticase Soja bouillon culturen van Bacillus subtilis en Escherichia coli.

PROCEDURE (te doen in tweetallen)

1. Verdeel de Magere Melk-agarplaat doormidden en ent de ene helft met Bacillus subtilis en de andere helft met Escherichia coli zoals hierboven gedaan met de bovenstaande zetmeelagarplaat (zie Fig. 7).

2. Incuberen ondersteboven en gestapeld in de petrischaalhouder op de plank van de 37°C-incubator die overeenkomt met uw laboratoriumsectie tot de volgende labperiode. Als caseïne wordt gehydrolyseerd, ontstaat er een duidelijke zone rond de bacteriegroei (zie figuur 1A). Als caseïne niet wordt gehydrolyseerd, blijft de agar wit en ondoorzichtig (zie afb. 1B).

C. FERMENTATIE VAN KOOLHYDRATEN

DISCUSSIE

Koolhydraten zijn complexe chemische substraten die dienen als energiebronnen wanneer ze worden afgebroken door bacteriën en andere cellen. Ze zijn samengesteld uit koolstof, waterstof en zuurstof (waarbij waterstof en zuurstof in dezelfde verhouding staan ​​als water; [CH2O]) en worden gewoonlijk geclassificeerd als suikers of zetmeel.

Facultatieve anaërobe en anaërobe bacteriën zijn in staat om: fermentatie, een anaëroob proces waarbij koolhydraten worden afgebroken voor energieproductie. Een grote verscheidenheid aan koolhydraten kan door verschillende bacteriën worden gefermenteerd om energie te verkrijgen en de soorten koolhydraten die door een specifiek organisme worden gefermenteerd, kunnen dienen als een diagnostisch hulpmiddel voor de identificatie van dat organisme.

We kunnen detecteren of een specifiek koolhydraat wordt gefermenteerd door: op zoek naar gemeenschappelijke eindproducten van fermentatie. Wanneer koolhydraten worden gefermenteerd als gevolg van bacteriële enzymen, de volgende fermentatie-eindproducten kunnen worden geproduceerd::

1. zure eindproducten, of
2. zure en gas eindproducten.

Om op deze fermentatieproducten te testen, inoculeer en incubeer je buizen met media die a enkele koolhydraat (zoals lactose of maltose), a pH-indicator (zoals fenolrood) en a Durham-buis (een kleine omgekeerde buis om gasproductie te detecteren).

  • Als de bacterie dat bepaalde koolhydraat alleen fermenteert en zure eindproducten produceert, zal het zuur de pH verlagen, waardoor de pH-indicator fenolrood verandert van zijn oorspronkelijke rode kleur bij een neutrale pH naar een gele of heldere kleur zie Afb. 2A).
  • Als de bacterie dat specifieke koolhydraat fermenteert en zowel zuur als gas produceert, verandert de pH-indicator fenolrood van zijn oorspronkelijke rode kleur bij een neutrale pH in een gele of heldere kleur en zal het gas zich in de Durham-buis verzamelen als een substantiële gasbel die verschijnt aan de bovenkant van de Durham-buis (zie afb. 2B).
  • Als het koolhydraat niet door de bacterie wordt gefermenteerd, er wordt geen zuur of gas geproduceerd en het fenolrood blijft rood (zie afb. 2C).

MEDIA

3 tubes Phenol Red Lactose-bouillon en 3 tubes Phenol Red Maltose-bouillon (zie Fig. 4D)

ORGANISMEN

Trypticase Soja agar culturen van Bacillus subtilis, Escherichia coli, en Staphylococcus aureus.

PROCEDURE (te doen in tweetallen)

1. Label elk buisje met de naam van de suiker in het buisje en de naam van de bacterie die je kweekt.

2. Ent één Phenol Red Lactose-bouillonbuisje en één Phenol Red Maltose-bouillonbuisje met: Bacillus subtilis.

3. Ent een tweede Phenol Red Lactose-bouillonbuisje en een tweede Phenol Red Maltose-bouillonbuisje met Escherichia coli.

4. Ent een derde Phenol Red Lactose bouillonbuis en een derde Phenol Red Maltose bouillonbuis met Staphylococcus aureus.

5. Incubeer de buisjes in je reageerbuisrek op je plank van de 37°C incubator die overeenkomt met uw laboratoriumsectie tot de volgende labperiode

D. INDOLE- EN WATERSTOFSULFIDEPRODUCTIE

DISCUSSIE

Soms zoeken we naar de productie van producten die door slechts enkele bacteriën worden geproduceerd. Sommige bacteriën gebruiken bijvoorbeeld het enzym tryptofanase om zet het aminozuur tryptofaan om in moleculen van indool, pyrodruivenzuur en ammoniak. Aangezien slechts enkele bacteriën tryptofanase bevatten, kan de vorming van indol uit een tryptofaansubstraat een ander nuttig diagnostisch hulpmiddel zijn voor de identificatie van een organisme. Indoolproductie is een belangrijke test voor de identificatie van Escherichia coli.

Door toe te voegen Kovac's reagens aan het medium na incubatie kunnen we bepalen of indol werd geproduceerd. Kovac's reagens zal reageren met de indool en draaien rood (zie afb. 5A).

Evenzo zijn sommige bacteriën in staat zwavelhoudende aminozuren (cystine, methionine) af te breken of anorganische zwavelhoudende verbindingen (zoals sulfiet, sulfaat of thiosulfaat) te reduceren tot waterstofsulfide (H2S). Dit gereduceerde zwavel kan dan worden opgenomen in andere cellulaire aminozuren, of misschien in co-enzymen. Het vermogen van een organisme om zwavelhoudende verbindingen te reduceren tot waterstofsulfide kan een andere test zijn voor het identificeren van onbekende organismen zoals bepaalde Proteus en Salmonella. Om te testen op waterstofsulfideproductie, wordt een medium met een zwavelhoudende verbinding en ijzerzouten geïnoculeerd en geïncubeerd. Als de zwavel wordt gereduceerd en waterstofsulfide wordt geproduceerd, zal het zich combineren met het ijzerzout om een ​​zichtbare zwart ijzersulfide (FeS) in de buis (zie Fig. 5B).

Als noch waterstofsulfide noch indol worden geproduceerd in SIM-medium, wordt de agar niet zwart en blijft het Kovac-reagens geel. (Fig. 5C).

MEDIUM

Drie buizen van SIM (Sulfide, Indole, Motility) medium (zie Fig. 5C). Dit medium bevat een zwavelbron, een ijzerzout, het aminozuur tryptofaan en heeft een halfvast agargehalte (0,3%). Het kan worden gebruikt om waterstofsulfideproductie, indolproductie en beweeglijkheid te detecteren.

ORGANISMEN

Trypticase Soja agar culturen van Proteus mirabilis, Escherichia coli, en Enterobacter cloacae.

PROCEDURE (te doen in tweetallen)

1. Steek een SIM-mediumbuis met Proteus mirabilis.

2. Steek een tweede SIM medium tube met Escherichia coli.

3. Steek een derde SIM-mediumbuis met Enterobacter cloacae.

4 . Incubeer de buisjes in je reageerbuisrek op je plank van de 37°C incubator die overeenkomt met uw laboratoriumsectie tot de volgende labperiode

5. Voeg de volgende laboratoriumperiode Kovac's reagens toe aan elke buis om de indolproductie te detecteren.

E. CATALASE-ACTIVITEIT (Demonstratie)

DISCUSSIE

Catalase is de naam van een enzym dat in de meeste bacteriën wordt aangetroffen en dat de afbraak van waterstof peroxide (H2O2) in water (H2O) en vrije zuurstof (O2).

Tijdens het normale proces van aërobe ademhaling, waterstofionen (H+) worden afgegeven en moeten door de cel worden verwijderd. De elektronentransportketen neemt deze waterstofionen en combineert ze met een half molecuul zuurstof (een zuurstofatoom) om water te vormen (H2O). Tijdens het proces wordt energie afgegeven en wordt deze opgesloten en opgeslagen in ATP. Water is dan een onschadelijk eindproduct. Sommige cytochromen in het elektronentransportsysteem vormen echter het giftige waterstofperoxide (H2O2) in plaats van water en dit moet worden verwijderd. Dit wordt gedaan door het enzym katalase dat het waterstofperoxide afbreekt in water en zuurstof, zoals hierboven weergegeven. De meeste bacteriën zijn catalase-positief; bepaalde geslachten die echter geen aerobe ademhaling uitvoeren, zoals de geslachten Streptococcus, Enterococcus, Lactobacillus, en Clostridium, zijn catalase-negatief.

MATERIALEN

Trypticase Soja-agarculturen van Staphylococcus aureus en Streptococcus lactis, 3% waterstofperoxide.

PROCEDURE (demonstratie)

Voeg aan elke kweek een paar druppels 3% waterstofperoxide toe en kijk of er zuurstof vrijkomt als gevolg van de afbraak van waterstofperoxide. Dit verschijnt als schuimvorming. (zie afb. 5A)

RESULTATEN

A. Zetmeelhydrolyse

Wanneer jodium aan zetmeel wordt toegevoegd, geeft het gevormde jodium-zetmeelcomplex een karakteristiek: donkerbruine of dieppaarse kleurreactie. Als het zetmeel door het diastase-exo-enzym is gehydrolyseerd tot glucosemoleculen, geeft het deze reactie niet meer.

Overspoel het oppervlak van de Zetmeel-agarplaat met gramjodium.

  • Als de bacterie een exo-enzym produceerde dat het zetmeel in de agar hydroliseerde?, een duidelijke zone zal de bacteriegroei omringen omdat: het zetmeel is er niet meer om te reageren met het jodium (zie Fig. 3A).
  • Als de bacterie mist het exo-enzym om het zetmeel af te breken, de agar rond de groei moet draaien donkerbruin of blauw/zwart kleur (zie Fig. 3B) vanwege het jodium-zetmeelcomplex.

Noteer je resultaten en geef aan welk organisme in staat was het zetmeel te hydrolyseren (+ = hydrolyse; - = geen hydrolyse).

B. Eiwithydrolyse

Het eiwit caseïne bestaat als een colloïdale suspensie in melk en geeft melk zijn karakteristiek wit, ondoorzichtig uiterlijk. Als de caseïne in de melk wordt gehydrolyseerd in peptiden en aminozuren, zal het zijn ondoorzichtigheid verliezen.

  • Als de bacterie een exo-enzym produceerde dat de caseïne kan hydrolyseren, zal er een duidelijke zone rond de bacteriegroei (zie afb. 1A).
  • Als de bacterie het exo-enzym mist om caseïne af te breken, de Magere Melk-agar blijft over wit en ondoorzichtig (zie afb. 1B).

Noteer je resultaten en geef aan welk organisme in staat was caseïne te hydrolyseren (+ = hydrolyse; - = geen hydrolyse).

C. Fermentatie van koolhydraten

Zoals hierboven vermeld, kunnen we detecteren of een specifiek koolhydraat wordt gefermenteerd door: op zoek naar gemeenschappelijke eindproducten van fermentatie. Wanneer koolhydraten worden gefermenteerd als gevolg van bacteriële enzymen, de volgende fermentatie-eindproducten kunnen worden geproduceerd::

1. zure eindproducten, of
2. zure en gas eindproducten.

De resultaten van fermentatie kunnen alleen zuur zijn of zuur plus gas, maar nooit alleen gas.

Fenolrode pH-indicator verschijnt rood of oranje bij neutrale pH en verschijnt geel of helder bij een zure pH.

  • Een verandering van kleur in de tube van rood of oranje tot geel of helder geeft aan dat het organisme dat specifieke koolhydraat heeft gefermenteerd, waardoor zure eindproducten zijn geproduceerd.
  • Een substantiële gasbel aan de bovenkant van de Durham-buis, de omgekeerde reageerbuis in de bouillon, geeft aan dat er ook gas werd geproduceerd door de fermentatie van het koolhydraat.
  • Als de fenolrood blijft rood, er werd geen zuur geproduceerd en het koolhydraat is niet gefermenteerd.

Mogelijke resultaten zijn als volgt:

  • Koolhydraatfermentatie produceren zuur maar geen gas: zuur (geel of helder); geen substantiële gasbel in de Durham-buis (zie Fig. 2A).
  • Koolhydraatfermentatie produceren zuur en gas: zuur (geel of helder) ; een aanzienlijke gasbel in de Durham-buis (zie Fig. 2B).
  • Geen koolhydraatfermentatie. Geen zuur of gas (neutrale pH (rood of oranje); geen substantiële gasbel in de Durham-buis (zie Fig. 2C).

Koolhydraatfermentatie
Noteer uw resultaten hieronder (+ = positief; - = negatief).

OrganismeFenol Rode MaltoseFenol Rode Lactose
Bacillus subtilis
Zuur
Gas
Fermentatie
Escherichia coli
Zuur
Gas

Fermentatie

Staphylococcus aureus
Zuur
Gas
Fermentatie

D. Productie van indool en waterstofsulfide

Voorzichtig voeg ongeveer 1/4 inch toe van Kovac's reagens aan elk van de 3 SIM-agarbuizen en observeer.

1. Productie van waterstofsulfide (H2S)

  • Als de bacterie produceert het enzym om zwavel te reduceren tot waterstofsulfide (H2S), zal de agar draaien zwart wat aangeeft dat het organisme heeft geproduceerd waterstofsulfide (zie afb. 5B).
  • Als de bacterie mist het enzym, de agar wordt niet zwart, wat aangeeft dat er geen waterstofsulfide is geproduceerd.

2. Productie van indool

  • Als de bacterie produceert het enzym om tryptofaan af te breken tot moleculen van indol, pyrodruivenzuur en ammoniak, de Kovac's reagens wordt rood, wat aangeeft dat het organisme is indool-positief (zie afb. 5A).
  • Als de Kovac's reagens blijft geel, er werd geen indol geproduceerd en het organisme is indool-negatief (zie afb. 5C).

SIM-medium
Noteer uw resultaten hieronder (+ = positief; - = negatief).

OrganismeIndoolwaterstofsulfide
Escherichia coli
Enterobacter cloacae
Proteus mirabilis

E. Catalase-activiteit

Catalase is de naam van een enzym dat in de meeste bacteriën wordt aangetroffen en dat de afbraak van waterstof peroxide (H2O2) in water en vrije zuurstof.

  • Als de bacterie produceert het enzym katalase, daarna het waterstofperoxide toegevoegd aan de cultuur zal zijn afgebroken tot water en vrije zuurstof. De zuurstof zal door het water borrelen een veroorzaken oppervlakte schuim te vormen. Dit is een katalase-positief bacterie (zie fig. 6A).
  • EEN katalase-negatief bacterie zal geen katalase produceren om het waterstofperoxide af te breken, en geen schuim zal optreden (zie Fig. 6B).

Catalase-test
Noteer uw resultaten hieronder (schuimvorming = positief; geen schuimvorming = negatief).

Organismekatalase reactie
Staphylococcus aureus
Streptococcus lactis

PRESTATIEDOELSTELLINGEN VOOR LAB 8

Na het voltooien van dit lab kan de student de volgende doelstellingen behalen:

INVOERING

1. Geef de chemische aard en functie van enzymen aan.

2. Definieer endo-enzym en exo-enzym.

A. ZETMEELHYDROLYSE

DISCUSSIE

1. Beschrijf een testmethode voor zetmeelhydrolyse en geef aan hoe de resultaten moeten worden geïnterpreteerd.

RESULTATEN

1. Interpreteer de resultaten van zetmeelhydrolyse op een zetmeelagarplaat die is ingeënt, geïncubeerd en overstroomd met jodium.

B. EIWITHYDROLYSE

DISCUSSIE

1. Beschrijf een testmethode voor caseïnehydrolyse en geef aan hoe de resultaten moeten worden geïnterpreteerd.

RESULTATEN

1. Interpreteer de resultaten van caseïnehydrolyse op een Magere Melk-agarplaat nadat deze is ingeënt en geïncubeerd.

C. FERMENTATIE VAN KOOLHYDRATEN

DISCUSSIE

1. Noem de algemene eindproducten die kunnen worden gevormd als gevolg van de bacteriële fermentatie van suikers en beschrijf hoe deze eindproducten het uiterlijk van een bouillonbuisje met suiker, de pH-indicator fenolrood en een Durham-buisje veranderen.

RESULTATEN

1. Interpreteer de koolhydraatfermentatieresultaten in buizen van Phenol Red Carbohydrate-bouillon die een Durham-buis bevat nadat deze is ingeënt en geïncubeerd.

D. INDOLE- EN WATERSTOFSULFIDEPRODUCTIE

DISCUSSIE

1. Geef de route aan voor de afbraak van tryptofaan tot indol. 2. Geef de route aan voor de detectie van zwavelreductie in SIM-medium.

3. Noem drie reacties waarop getest kan worden in SIM-medium en beschrijf hoe de resultaten geïnterpreteerd moeten worden.

RESULTATEN

1. Interpreteer de waterstofsulfide- en indoolresultaten in een SIM-mediumbuis na inoculatie, incubatie en toevoeging van Kovac's reagens.

E. CATALASE-ACTIVITEIT

DISCUSSIE

1. Noem de functie van het enzym catalase en beschrijf een methode om te testen op catalase-activiteit.

RESULTATEN

1. Interpreteer de resultaten van een katalasetest na toevoeging van waterstofperoxide aan een plaatcultuur van bacteriën.

ZELFQUIZ


Lab 8: Biochemische testen gebruiken om bacteriën te identificeren - Biologie

Nauwkeurige identificatie van bacteriële isolaten is essentieel in een klinisch microbiologisch laboratorium, omdat de resultaten vaak leiden tot beslissingen over behandeling die rechtstreeks van invloed zijn op de resultaten van de patiënt. Gevallen van voedselvergiftiging vereisen bijvoorbeeld een nauwkeurige identificatie van de veroorzaker, zodat artsen de juiste behandeling kunnen voorschrijven. Evenzo is het belangrijk om de veroorzakende ziekteverwekker nauwkeurig te identificeren tijdens een uitbraak van een ziekte, zodat geschikte strategieën kunnen worden gebruikt om de epidemie in te dammen.

Er zijn veel manieren om micro-organismen te detecteren, karakteriseren en identificeren. Sommige methoden zijn gebaseerd op fenotypische biochemische kenmerken, terwijl andere gebruikmaken van genotypische identificatie. De biochemische kenmerken van een bacterie bieden veel eigenschappen die nuttig zijn voor classificatie en identificatie. Het analyseren van de voedings- en metabolische vermogens van het bacteriële isolaat is een gebruikelijke benadering voor het bepalen van het geslacht en de soort van de bacterie. Enkele van de belangrijkste metabole routes die bacteriën gebruiken om te overleven, zullen worden besproken in Microbial Metabolism. In deze sectie zullen we enkele methoden bespreken die biochemische kenmerken gebruiken om micro-organismen te identificeren.

Sommige micro-organismen slaan bepaalde verbindingen op als: korrels binnen hun cytoplasma, en de inhoud van deze korrels kan worden gebruikt voor identificatiedoeleinden. Bijvoorbeeld, poly-β-hydroxybutyraat (PHB) is een koolstof- en energieopslagverbinding die wordt aangetroffen in sommige niet-fluorescerende bacteriën van het geslacht Pseudomonas. Verschillende soorten binnen dit geslacht kunnen worden geclassificeerd door de aanwezigheid of afwezigheid van PHB en fluorescerende pigmenten. De menselijke ziekteverwekker P. aeruginosa en de plantenziekteverwekker P. syringae zijn twee voorbeelden van fluorescerend Pseudomonas soorten die geen PHB-korrels accumuleren.

Andere systemen vertrouwen op biochemische kenmerken om micro-organismen te identificeren aan de hand van hun biochemische reacties, zoals koolstofgebruik en andere metabole tests. In kleine laboratoriumomgevingen of in onderwijslaboratoria worden die testen uitgevoerd met een beperkt aantal reageerbuisjes. Modernere systemen, zoals die ontwikkeld door Biolog, Inc., zijn echter gebaseerd op panelen van biochemische reacties die gelijktijdig worden uitgevoerd en door software worden geanalyseerd. Het systeem van Biolog identificeert cellen op basis van hun vermogen om bepaalde biochemicaliën te metaboliseren en op basis van hun fysiologische eigenschappen, waaronder pH en chemische gevoeligheid. Het gebruikt alle belangrijke klassen van biochemicaliën in zijn analyse. Identificaties kunnen handmatig of met de semi- of volledig geautomatiseerde instrumenten worden uitgevoerd.

Een ander geautomatiseerd systeem identificeert micro-organismen door het massaspectrum van het monster te bepalen en het vervolgens te vergelijken met een database die bekende massaspectra voor duizenden micro-organismen bevat. Deze methode is gebaseerd op matrix-geassisteerde laserdesorptie/ionisatie time-of-flight massaspectrometrie (MALDI-TOF) en gebruikt wegwerp MALDI-platen waarop het micro-organisme wordt gemengd met een gespecialiseerd matrixreagens (Figuur 1). Het monster/reagensmengsel wordt bestraald met een gepulste ultraviolette laser met hoge intensiteit, wat resulteert in de uitwerping van gasvormige ionen die worden gegenereerd door de verschillende chemische bestanddelen van het micro-organisme. Deze gasvormige ionen worden verzameld en versneld door de massaspectrometer, waarbij ionen reizen met een snelheid die wordt bepaald door hun massa-tot-ladingverhouding (m/z), en zo de detector op verschillende tijdstippen bereiken. Een grafiek van het detectorsignaal versus m/z levert een massaspectrum op voor het organisme dat uniek gerelateerd is aan zijn biochemische samenstelling. Vergelijking van het massaspectrum met een bibliotheek van referentiespectra verkregen uit identieke analyses van bekende micro-organismen maakt identificatie van de onbekende microbe mogelijk.

Figuur 1. MALDI-TOF-methoden worden nu routinematig gebruikt voor diagnostische procedures in klinische microbiologische laboratoria. Deze technologie is in staat om snel enkele micro-organismen te identificeren die niet gemakkelijk kunnen worden geïdentificeerd met meer traditionele methoden. (credit '8220MALDI plaat foto'8221: wijziging van het werk door Chen Q, Liu T, Chen G credit '8220graphs'8221: wijziging van het werk van Bailes J, Vidal L, Ivanov DA, Soloviev M)

Microben kunnen ook worden geïdentificeerd door hun unieke lipidenprofielen te meten. Zoals we hebben geleerd, kunnen vetzuren van lipiden variëren in ketenlengte, aanwezigheid of afwezigheid van dubbele bindingen en aantal dubbele bindingen, hydroxylgroepen, vertakkingen en ringen. Om een ​​microbe te identificeren aan de hand van zijn lipidensamenstelling, worden de vetzuren in hun membranen geanalyseerd. Een veelgebruikte biochemische analyse die voor dit doel wordt gebruikt, is een techniek die wordt gebruikt in klinische, volksgezondheids- en voedsellaboratoria. Het is gebaseerd op het detecteren van unieke verschillen in vetzuren en heet vetzuurmethylester (FAME) analyse. In een FAME-analyse, vetzuren worden geëxtraheerd uit de membranen van micro-organismen, chemisch veranderd om vluchtige methylesters te vormen en geanalyseerd door gaschromatografie (GC). Het resulterende GC-chromatogram wordt vergeleken met referentiechromatogrammen in een database met gegevens voor duizenden bacteriële isolaten om het onbekende micro-organisme te identificeren (Figuur 2).

Figuur 2. Vetzuurmethylester (FAME) analyse bij bacteriële identificatie resulteert in een chromatogram dat uniek is voor elke bacterie. Elke piek in het gaschromatogram komt overeen met een bepaalde vetzuurmethylester en de hoogte ervan is evenredig met de hoeveelheid die in de cel aanwezig is. (credit '8220culture'8221: wijziging van het werk door de Centers for Disease Control and Prevention credit '8220graph'8221: wijziging van het werk door Zhang P. en Liu P.)

Een verwante methode voor identificatie van micro-organismen heet fosfolipide-afgeleide vetzuren (PLFA) analyse. Membranen zijn meestal samengesteld uit fosfolipiden, die kunnen worden verzeept (gehydrolyseerd met alkali) om de vetzuren vrij te maken. Het resulterende vetzuurmengsel wordt vervolgens onderworpen aan FAME-analyse en de gemeten lipidenprofielen kunnen worden vergeleken met die van bekende micro-organismen om het onbekende micro-organisme te identificeren.

Bacteriële identificatie kan ook gebaseerd zijn op de eiwitten die onder specifieke groeiomstandigheden in het menselijk lichaam worden geproduceerd. Dit soort identificatieprocedures worden proteomische analyse. Om proteomische analyse uit te voeren, worden eiwitten van de ziekteverwekker eerst gescheiden door hogedruk vloeistofchromatografie (HPLC)en de verzamelde fracties worden vervolgens verteerd om kleinere peptidefragmenten op te leveren. Deze peptiden worden geïdentificeerd door massaspectrometrie en vergeleken met die van bekende micro-organismen om het onbekende micro-organisme in het oorspronkelijke monster te identificeren.

Micro-organismen kunnen ook worden geïdentificeerd door de koolhydraten die aan eiwitten (glycoproteïnen) in het plasmamembraan of de celwand zijn bevestigd. Antilichamen en andere koolhydraatbindende eiwitten kunnen zich hechten aan specifieke koolhydraten op celoppervlakken, waardoor de cellen samenklonteren. Serologische tests (bijv. de Lancefield-groepen tests, die worden gebruikt voor de identificatie van Streptokokken soorten) worden uitgevoerd om de unieke koolhydraten op het oppervlak van de cel te detecteren.

Klinische focus: Cristina, resolutie

Dit voorbeeld sluit het verhaal van Cristina af dat begon in Organische moleculen en lipiden.

Figuur 3. Blootstelling aan Pseudomonas aeruginosa in het water van een zwembad of bubbelbad kan soms leiden tot een huidinfectie die zich manifesteert als "8220hot tub-uitslag"" (credit: wijziging van het werk door "8220Lsupellmel"8221/Wikimedia Commons)

Cristina stopte met het gebruik van haar nieuwe zonnebrandcrème en bracht de corticosteroïdencrème aan op haar uitslag zoals voorgeschreven. Na enkele dagen was haar uitslag echter niet verbeterd en leek ze zelfs erger te worden. Ze maakte een vervolgafspraak met haar arts, die een hobbelige rode uitslag en met pus gevulde blaren rond de haarzakjes zag (Figuur 3). De uitslag was vooral geconcentreerd in gebieden die zouden zijn bedekt door een zwempak. Na wat ondervraging vertelde Cristina de arts dat ze onlangs een poolparty had bijgewoond en enige tijd in een bubbelbad had doorgebracht. In het licht van deze nieuwe informatie vermoedde de arts een geval van hot tub uitslag, een infectie die vaak door de bacterie wordt veroorzaakt Pseudomonas aeruginosa, een opportunistische ziekteverwekker die kan gedijen in bubbelbaden en zwembaden, vooral wanneer het water niet voldoende gechloreerd is. P. aeruginosa is dezelfde bacterie die wordt geassocieerd met infecties in de longen van patiënten met taaislijmziekte.

De arts verzamelde een monster van Cristina's uitslag om naar het laboratorium voor klinische microbiologie te sturen. Er werden bevestigende tests uitgevoerd om onderscheid te maken P. aeruginosa van enterische pathogenen die ook aanwezig kunnen zijn in zwembad- en bubbelbadwater. De test omvatte de productie van het blauwgroene pigment pyocyanine op cetrimide-agar en groei bij 42 °C. Cetrimide is een selectief middel dat de groei van andere soorten microbiële flora remt en ook de productie van P. aeruginosa pigmenten pyocyanine en fluoresceïne, die respectievelijk een karakteristiek blauwgroen en geelgroen zijn.

Tests bevestigden de aanwezigheid van P. aeruginosa in Cristina's huidmonster, maar de arts besloot geen antibioticum voor te schrijven. Ondanks dat P. aeruginosa is een bacterie, Pseudomonas soorten zijn over het algemeen resistent tegen veel antibiotica. Gelukkig zijn huidinfecties zoals die van Cristina meestal zelfbeperkend. De uitslag duurt meestal ongeveer 2 weken en verdwijnt vanzelf, met of zonder medische behandeling. De arts adviseerde Cristina om het af te wachten en de corticosteroïdencrème te blijven gebruiken. De crème zal de niet doden P. aeruginosa op Cristina's huid, maar het zou haar uitslag moeten kalmeren en de jeuk moeten verminderen door de ontstekingsreactie van haar lichaam op de bacteriën te onderdrukken.

Sleutelbegrippen en samenvatting

  • Nauwkeurige identificatie van bacteriën is essentieel in een klinisch laboratorium voor het diagnosticeren en beheersen van epidemieën, pandemieën en voedselvergiftiging veroorzaakt door bacteriële uitbraken.
  • De fenotypische identificatie van micro-organismen omvat het gebruik van waarneembare eigenschappen, waaronder profielen van structurele componenten zoals lipiden, biosynthetische producten zoals suikers of aminozuren, of opslagverbindingen zoals poly-β-hydroxybutyraat.
  • Een onbekende microbe kan worden geïdentificeerd aan de hand van het unieke massaspectrum dat wordt geproduceerd wanneer het wordt geanalyseerd door matrix-ondersteunde laserdesorptie/ionisatie vluchttijd massaspectrometrie (MALDI-TOF).
  • Microben kunnen worden geïdentificeerd door hun lipidensamenstelling te bepalen met behulp van vetzuurmethylesters (ROEM) of van fosfolipiden afgeleide vetzuren (PLFA) analyse.
  • Proteomische analyse, kan de studie van alle geaccumuleerde eiwitten van een organisme ook worden gebruikt voor bacteriële identificatie.
  • Glycoproteïnen in het plasmamembraan of celwandstructuren kunnen binden aan lectines of antilichamen en kunnen worden gebruikt voor identificatie.

Meerkeuze

Welke van de volgende kenmerken/verbindingen wordt niet beschouwd als een fenotypisch biochemisch kenmerk dat wordt gebruikt voor microbiële identificatie?

  1. poly-β-hydroxybutyraat
  2. kleine subeenheid (16S) rRNA-gen
  3. koolstofgebruik
  4. lipide samenstelling

Proteomische analyse is een methodologie die zich bezighoudt met welke van de volgende?

  1. de analyse van eiwitten die functioneren als enzymen in de cel
  2. analyse van transporteiwitten in de cel
  3. de analyse van integrale eiwitten van het celmembraan
  4. de studie van alle geaccumuleerde eiwitten van een organisme

Bij welke methode worden gasfase-ionen gegenereerd uit intacte micro-organismen?

Welke methode omvat de analyse van membraangebonden koolhydraten?

Bij welke methode worden de lipiden van een microbe omgezet in vluchtige verbindingen voor analyse door middel van gaschromatografie?

Vul de blanco in

Een FAME-analyse omvat de conversie van _______ naar meer vluchtige _____ voor analyse met ____________.

Waar onwaar

MALDI-TOF vertrouwt op het verkrijgen van een uniek massaspectrum voor de geteste bacteriën en het vervolgens controleren van het verkregen massaspectrum tegen de spectrumdatabases die zijn geregistreerd in de analysesoftware om het micro-organisme te identificeren.

Lancefield-groepstests kunnen microben identificeren met behulp van antilichamen die specifiek aan celoppervlakte-eiwitten binden.

Denk er over na

Vergelijk MALDI-TOF, FAME en PLFA en leg uit hoe elke techniek zou worden gebruikt om pathogenen te identificeren.


Vroege microbiële identificatiestudies door microscopie

De vroegste microbiële identificaties waren gebaseerd op observaties van de fysieke kenmerken van de microbe: vorm, grootte en de soorten kleurstoffen die het absorbeerde. Antoni van Leeuwenhoek zag voor het eerst microben door een microscoop in de jaren 1670. Deze microben waren afkomstig van rottende lichamen, dieren, groenten en water. Hij documenteerde de bevindingen en beschreef wat hij zag als 'dieren', afgeleid van het Latijnse 'diertje' of 'klein dier'.

Om de microscopisch kleine onder ons beter zichtbaar te maken, ontwikkelde Hans Christian Gram in 1884 de Gram-kleuringstechniek. Gram creëerde deze techniek om bacteriën beter zichtbaar te maken in gekleurde longweefselcoupes, en niet voor het classificeren van microben, zoals het tegenwoordig vaak wordt toegepast. Andere soorten kleuring kunnen microbiologen vertellen of bepaalde kenmerken aanwezig zijn: sporen (Schaeffer-Fulton-kleuring), capsules (Oost-Indische inkt of nigrosine) en mycolzuren (zuurvaste kleuring).

De Gram-kleuring onderscheidt organismen door de manier waarop ze reageren met gekleurde vlekken: Gram-negatieve staven (L) kleuren roze/rood Gram-positieve staven (R) kleuren blauw/paars.


Algemene biochemische tests

This lab should help give you the background information and techniques you will need to successfully perform general biochemical tests in order to help identify unknown bacterial samples. The micro lab website, your textbook, the web and assorted books available in lab will be the reference materials necessary for you to successfully complete the next several weeks of lab work.

  • You will perform general biochemical tests on an unknown organism.
  • For each biochemical test you perform, make sure to record the following in your lab book:
    • What does a positive test result look like?
    • What is the biochemical basis of the test?

    Lab Procedure

    We have included the basic procedure for doing each biochemical test in the table below. You will find more specific procedures for each biochemical test on the following pages. More complete information on selective & differential media can be obtained by consulting the Difco manuals in lab. You will need to look up the individual test for a more detailed description, including the biochemical basis of each test.

    Table 1: Brief Description of general tests and probable results.

    Toets Brief Instructions Probable Results
    TSA/BHI Staphs/Enterics on TSA Streps on BHI Determine macromorphology
    Gramkleuring To confirm culture purity Staphs/Streps (Gram+), Enterics (Gram-)
    beweeglijkheid Stab with a needle straight in and straight out of the center of the tube half way down.
    Incubeer gedurende 24 uur bij 37°C.
    Staphs/Enterics in O2 Streps in CO2.
    Motile organisms have obvious growth away from inoculation area Non-motile organisms grow only in inoculation area.
    McFarland Standard Dilute your organism in a tube of sterile water to obtain a turbidity equivalent to a 0.5 McFarland test standard. Hold your diluted tube and the 0.5 McFarland test standard against the black-lined McFarland reference card to accurately rate the turbidity.
    FTM Use a sterile transfer pipette to add 1 mL of your McFarland standard organism in the middle of the tube. Cap tightly do not jostle. Incubeer gedurende 24 uur bij 37°C. Strict aerobes will grow near the top of the media Facultative anaerobes will grow throughout Strict anaerobes will grow near the bottom.
    Catalase Transfer a well-isolated colony to a clean slide & add 1 drop of 3% H2O2. Do not reverse the order & do not mix. Observe for immediate bubble formation. Staphs/Enterics are catalase positive bubble formation should occur. Note: do not take colony from a blood plate.
    Oxidase Add a few drops of oxidase reagent onto Whatman filter paper. Smear with a loop-full of organisms. Use colonies from low glucose, non-selective media. Look for appearance of purple color within 30 seconds.

    Motility Test Medium

    Intended Use

    Beginsel

    Motility is apparent by the presence of diffuse growth away from the line of inoculation.

    Test procedure

    1. Inoculate with growth from an 18-24 hour culture by stab inoculation with a needle.
    2. Incubate at a temperature and duration appropriate for the organism being tested.
    3. Examine tubes for growth and signs of motility.

    Resultaten

    • Motility is apparent by the presence of diffuse growth away from the line of inoculation.
    • Non-motile organisms only grow along the line of inoculation.

    Beperkingen

    • The motility of Proteus spp. is temperature dependent.
    • Due to the temperature dependency of motility in some organisms, a negative tube should be incubated an additional 5 days at a lower temperature of 22-25°C.

    Fluid Thioglycolate Medium (FTM)

    Tests the oxygen requirements of different microorganisms.

    Intended Use

    Characterizes microbes according to their oxygen requirements

    Beginsel

    Various types of bacteria require various oxygen (or oxygen-free) environments to grow in.

    Test procedure

    1. Verdun uw organisme in een buis met steriel water om een ​​troebelheid te verkrijgen die gelijk is aan de 0,5 McFarland-teststandaard. Hold your diluted tube and the 0.5 McFarland test standard against the black-lined McFarland reference card to accurately rate the turbidity.
    2. Plaats met een steriele pipet van 1 ml 1 ml organisme in het midden van de buis.
    3. Cap tightly do not jostle.
    4. Incubeer gedurende 24 uur bij 37°C.

    Resultaten

    • Strict (obligate) aerobes grow at the surface of the medium where there is a high concentration of oxygen.
    • Obligate anaerobes grow near the bottom of the broth tube where there is no oxygen.
    • Facultative anaerobes grow best where more oxygen is present, but growth will occur throughout the broth tube.

    Catalase

    Intended Use

    • Differentiates Streptococcus (-) from Micrococcus (+)
    • Differentiates Staphylococcus (V+) and Bacillus (+) from Clostridium (-)

    Beginsel

    Hydrogen peroxide (H2O2) is the end product of aerobic breakdown of sugars. Since it is toxic to bacterial cells, most aerobic bacteria produce catalase or peroxidase to protect themselves. Streptococcus, Enterococcus, and Lactobacillis are exceptions. Since they do not use the cytochrome c pathway, they do not produce H2O2 and lack catalase.

    Test procedure

    1. Transfer a well isolated colony to a clean glass slide and add 1 drop of 3% H2O2.
      • Do not reverse the order and do not mix.
    2. Observe for immediate bubble formation.
    3. Use 15% H2O2 for the detection of catalase in anaerobes.

    Resultaten

    Beperkingen

    • Do not take your colony from a blood agar plate. The catalase present in the erythrocytes will give a false positive result.
    • H2O2 is unstable. You can do a quality control test of the H2O2 reagent by placing a drop on a blood agar plate. Vigorous bubbling should result.

    Oxidase Biochemical Assay

    Tests for the presence of the enzyme indophenol oxidase.

    Intended Use

    The oxidase test is based on the production of an enzyme called indophenols oxidase. This enzyme oxidizes a redox dye (present in the reagent) which results in a color change of yellow to dark purple.

    Beginsel

    Indophenol oxidase, in the presence of atmospheric oxygen, oxidizes the phenylenediamine oxidase reagent to form a dark purple compound, indophenol.

    Test procedure

    1. Have your instructor or IA crush the ampule inside the dropper.
    2. Tap bottom on tabletop a few times. Then invert for convenient drop-by-drop dispensing of reagent
    3. Preparation for testing:
      • Colonies to be tested must be isolated from other colonies
      • The use of fresh isolates (18-24 hr cultures) is recommended for routine testing.
      • If refrigerated, cultures must be allowed to reach room temperature prior to testing
    4. Performing the test – Filter Paper Method
      • Add a few drops of oxidase test reagent to a strip of filter paper (Whatman No. 1 or equivalent).
      • Streak a loopful of bacteria onto the reagent-saturated paper with a platinum loop or wooden applicator stick. Use of steel of nichrome loops may cause false-positive reactions

    Resultaten

    Positive reactions turn the bacteria violet to purple immediately, or up to 30 seconds. Negative reactions remain colorless or turn light pink/light purple after 30 seconds. Delayed reactions should be ignored.


    What is the use of biochemical tests in microbiology?

    Biochemical tests in microbiology are used to diagnose diseases caused by microbes and to monitor treatments administered to combat them. Additionally, they are used for the screening of infectious diseases and for their prognosis.

    The biochemical identification of microorganisms offers an idea of ​​what these microorganisms are capable of doing, being possible the discrimination of different strains of the same species by specific biochemical profiles.

    Differences in specific enzymatic activities inform about the ecology, physiology or natural habitat of the microorganism, which in some cases can be considered important information.


    Biochemical Test and Identification of Proteus mirabilis

    What are the biochemical test and identification of Proteus vulgaris?

    first and foremost the most identifications of test for proteus spp by urease test ,PPA
    The socond biochemical test indole the are defrenciate to p. Mirabilis from p vulgaris. If indole positve_ P.vllulgaris if negative – P.mirabilis

    may I know the result for coagulase test?

    What is best identification of corynebacterium diphtheria

    Loefler’s serum slant or Tindales agar are selective media for cornye. Cornye has a particular look on the Tinsdale agar. Then you’ll do your regular gram stains (Gram Positive bacilli, sometimes with club shape), catalase (positive), urease test (negative), growth is not supported on a MacConkey agar. Albert stain for confirmation to show green tail and reddish metachromatic granules. Carbohydrate Fermentation test: Maltose- Negative , Dextrose-Positive, Starch-Positive, Sucrose-Negative. The positive results for the starch and the negative results for the sucrose show the presence of a species of Corynebacterium diphtheriae (gravis).

    what is media choice of growing Proteus mirabilis

    Nutrient agar is always a safe choice. MacConkey is usually fairly decent, especially if you want to test the lactose fermentation thing. Finally, blood agar is always really cool for p. mirabilis, because the organism has a tendency to swarm across the agar (because of it’s high motility), so that’s cool to see.


    Modern Methods for Identifying Microbes

    Although still widely used, traditional methods for identifying microbes suffer from two major drawbacks. First, they are applicable only to organisms that can be cultured in vitro. Second, some strains exhibit unique biochemical characteristics that don’t fit the pattern of any known genus and species.

    Fortunately, many modern methods for identifying microbes aren’t dependent on live cultures, and they can often reveal minute differences between organisms that escape detection by traditional means.

    6. Identifying Microbes Using PCR

    • PCR, including Real-Time PCR, is probably the most widely used molecular technique for identifying microbes. Using PCR, one can rapidly detect and identify microbial species directly from clinical samples, thus speeding up diagnostic procedures.
    • Several PCR-based methods exist. Most involve a universal set of PCR primers that identify bacterial/fungal samples by sequencing the PCR amplicons.
    • The 16S rRNA gene is the gold-standard sequence for bacterial identification by PCR, while the Internal Transcribed Spacer (ITS) region is the primary barcode marker for fungal species.

    7. Microarray-Based Identification

      relies on the hybridization of pre-amplified microbial DNA sequences to arrayed species-specific oligonucleotide probes. Each probe contains a distinct dye that fluoresces on hybridization.
  • Microarrays are a versatile tool, facilitating the detection and discrimination of different microbial samples on a single slide. Microarray is a fast technique, and speed is important in clinical settings for diagnosis and the timely initiation of proper antimicrobial therapy.
  • Microarray-based platforms typically use similar barcode regions as other PCR-based methods (above).
  • 8. Immunological Identification

      can be set up for microbial detection (usually within diagnostics) on a species-by-species basis.
    • These methods are highly sensitive but they rely on very specific antibodies and highly discriminating protein(s) within the organism of interest.

    9. Chemical/Analytical Identification

    Fatty Acid Profiling

    • Fatty acids are essential within bacterial cell membranes, and different bacterial species produce different combinations of fatty acids. This fatty acids profile can be used to determine an unidentified bacterial species by matching against known profiles.
    • Fatty acid profiling is typically performed using a combination of gas chromatography and mass spectrometry.

    Metabolic Profiles/Chemo-Profiling

    • Besides primary metabolites (e.g. ATP, ADP) that are essential for growth, microbes produce a plethora of secondary metabolites that aren’t essential for growth but may be advantageous within certain environments, e.g. outcompeting other microorganisms for nutrients.
    • Secondary metabolites include antibiotics, immunosuppressive compounds, pigments, and antioxidants. These metabolites are a huge source of existing and newly emerging drugs.
    • Different species often produce unique secondary metabolite profiles, which allow us to identify known microbial species. Metabolic profiling is usually carried out using HPLC and mass spectrometry.

    Do you use any other methods for identifying microbes? Just drop us a line in the comments section and let us know!


    Bekijk de video: TRIAL PERAK 2020 KERTAS 1 BIOLOGYBIOLOGI (November 2022).